Prokaryotic RNA Sequencing

Prokaryotic RNA Seq

박테리아 등 원핵생물 전용의 RNA 시퀀싱 서비스. 미생물 시스템의 유전자 발현 및 조절 반응을 규명하기 위한 전사체 전반 프로파일링입니다.

원핵생물 RNA 시퀀싱은 NGS 기술을 활용하여 원핵생물 전사체를 시퀀싱하고, 모든 코딩 및 비코딩 RNA 전사산물에 대한 데이터를 신속하고 체계적으로 확보합니다. 더욱 정확한 전사산물 발현량 추정을 위해 가닥 특이적 RNA 라이브러리를 통해 전사체를 프로파일링합니다.

Novogene은 cDNA 라이브러리 구축 및 시퀀싱에 첨단 Illumina NovaSeq 플랫폼을 사용합니다. 이 플랫폼은 150염기쌍(bp) 페어드엔드 프로토콜을 적용하여 정확도와 품질이 뛰어난 쇼트 리드 데이터를 일관되게 생성합니다. 풍부한 업계 경험과 대규모 시퀀싱 역량을 바탕으로 Novogene은 다양한 연구 요구에 맞춘 포괄적인 서비스 포트폴리오를 제공합니다.

노보진 Prokaryotic RNA Seq의 장점

풍부한 전문성

연간 100만 개 이상의 RNA-seq 샘플을 성공적으로 처리한 실적을 보유한 Novogene은 신뢰받는 유전체 시퀀싱 분야의 선도 기업입니다.

맞춤형 솔루션

복잡하거나 까다로운 샘플의 고유한 요구사항을 충족하도록 설계된 맞춤형 워크플로와 전문 분석을 활용할 수 있습니다.

탁월한 데이터 품질

Novogene은 업계 기준을 지속적으로 뛰어넘는 정확도 높은 고품질 데이터를 제공하여 연구 목표 달성을 지원합니다.

Prokaryotic RNA Seq의 응용 분야

원핵생물 RNA-seq은 세균과 고세균의 유전자 발현 및 조절 체계를 종합적으로 파악할 수 있도록 하며, 미생물 생리학, 병원성 및 스트레스 적응 연구를 지원합니다.

환경 영향 분석

환경 변화가 미생물의 생물학적 기능과 생태학적 역할에 미치는 영향을 탐구합니다.

스트레스 반응 메커니즘

다양한 스트레스 조건에서 미생물의 생리적 적응을 조사하여 생존 전략을 규명합니다.

형질 차이 연구

특정 처리로 유발된 표현형 변화 또는 차별적 형질을 결정하는 핵심 기능 유전자를 식별합니다.

세부사항

샘플 준비방법

샘플 양은 참고용으로만 제시되어 있습니다. 자세한 내용은 샘플준비 가이드를 다운로드하여 확인하세요. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Library Type	Sample Type	Amount	RNA Integrity Number	Purity
Prokaryotic RNA Library	Total RNA	≥ 500 ng	≥ 6.0, smooth base line	A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination

샘플 준비방법

Library Type	Sample Type	Amount	RNA Integrity Number	Purity
Prokaryotic RNA Library	Total RNA	≥ 500 ng	≥ 6.0, smooth base line	A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination

샘플 준비방법

Library Type	Sample Type	Amount	RNA Integrity Number	Purity
Prokaryotic RNA Library	Total RNA	≥ 500 ng	≥ 6.0, smooth base line	A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination

샘플 준비방법

Library Type	Sample Type	Amount	RNA Integrity Number	Purity
Prokaryotic RNA Library	Total RNA	≥ 500 ng	≥ 6.0, smooth base line	A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Sequencing Platform	Illumina NovaSeq System
Read Length	Paired-end 150bp
Recommended Data Amount	≥ 2Gb raw data per sample for the species with reference genome
Content of Data Analysis	• Data Quality Control • Alignment to Reference Genome • Gene Expression Analysis • Novel Transcript Prediction • Gene expression quantification & differential expression analysis • Enrichment Analysis • Operon, Promoter and TSS/TTS Prediction • SD Sequence Prediction • Rho-independent Terminator Sequence Prediction • sRNA Secondary Structure Prediction • sRNA Targeted Gene Prediction

프로젝트 워크플로우

Novogene의 원핵생물 RNA-seq 워크플로는 엄격한 단계별 프로세스를 통해 고품질 결과를 보장합니다.

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Sequencing Platform	Illumina NovaSeq System
Read Length	Paired-end 150bp
Recommended Data Amount	≥ 2Gb raw data per sample for the species with reference genome
Content of Data Analysis	• Data Quality Control • Alignment to Reference Genome • Gene Expression Analysis • Novel Transcript Prediction • Gene expression quantification & differential expression analysis • Enrichment Analysis • Operon, Promoter and TSS/TTS Prediction • SD Sequence Prediction • Rho-independent Terminator Sequence Prediction • sRNA Secondary Structure Prediction • sRNA Targeted Gene Prediction

프로젝트 워크플로우

Novogene의 원핵생물 RNA-seq 워크플로는 엄격한 단계별 프로세스를 통해 고품질 결과를 보장합니다.

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Sequencing Platform	Illumina NovaSeq System
Read Length	Paired-end 150bp
Recommended Data Amount	≥ 2Gb raw data per sample for the species with reference genome
Content of Data Analysis	• Data Quality Control • Alignment to Reference Genome • Gene Expression Analysis • Novel Transcript Prediction • Gene expression quantification & differential expression analysis • Enrichment Analysis • Operon, Promoter and TSS/TTS Prediction • SD Sequence Prediction • Rho-independent Terminator Sequence Prediction • sRNA Secondary Structure Prediction • sRNA Targeted Gene Prediction

프로젝트 워크플로우

Novogene의 원핵생물 RNA-seq 워크플로는 엄격한 단계별 프로세스를 통해 고품질 결과를 보장합니다.

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Sequencing Platform	Illumina NovaSeq System
Read Length	Paired-end 150bp
Recommended Data Amount	≥ 2Gb raw data per sample for the species with reference genome
Content of Data Analysis	• Data Quality Control • Alignment to Reference Genome • Gene Expression Analysis • Novel Transcript Prediction • Gene expression quantification & differential expression analysis • Enrichment Analysis • Operon, Promoter and TSS/TTS Prediction • SD Sequence Prediction • Rho-independent Terminator Sequence Prediction • sRNA Secondary Structure Prediction • sRNA Targeted Gene Prediction

프로젝트 워크플로우

Novogene의 원핵생물 RNA-seq 워크플로는 엄격한 단계별 프로세스를 통해 고품질 결과를 보장합니다.

세부사항

샘플 준비방법

Library Type	Sample Type	Amount	RNA Integrity Number	Purity
Prokaryotic RNA Library	Total RNA	≥ 500 ng	≥ 6.0, smooth base line	A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination

샘플 준비방법

Library Type	Sample Type	Amount	RNA Integrity Number	Purity
Prokaryotic RNA Library	Total RNA	≥ 500 ng	≥ 6.0, smooth base line	A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination

샘플 준비방법

Library Type	Sample Type	Amount	RNA Integrity Number	Purity
Prokaryotic RNA Library	Total RNA	≥ 500 ng	≥ 6.0, smooth base line	A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination

샘플 준비방법

Library Type	Sample Type	Amount	RNA Integrity Number	Purity
Prokaryotic RNA Library	Total RNA	≥ 500 ng	≥ 6.0, smooth base line	A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Sequencing Platform	Illumina NovaSeq System
Read Length	Paired-end 150bp
Recommended Data Amount	≥ 2Gb raw data per sample for the species with reference genome
Content of Data Analysis	• Data Quality Control • Alignment to Reference Genome • Gene Expression Analysis • Novel Transcript Prediction • Gene expression quantification & differential expression analysis • Enrichment Analysis • Operon, Promoter and TSS/TTS Prediction • SD Sequence Prediction • Rho-independent Terminator Sequence Prediction • sRNA Secondary Structure Prediction • sRNA Targeted Gene Prediction

프로젝트 워크플로우

Novogene의 원핵생물 RNA-seq 워크플로는 엄격한 단계별 프로세스를 통해 고품질 결과를 보장합니다.

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Sequencing Platform	Illumina NovaSeq System
Read Length	Paired-end 150bp
Recommended Data Amount	≥ 2Gb raw data per sample for the species with reference genome
Content of Data Analysis	• Data Quality Control • Alignment to Reference Genome • Gene Expression Analysis • Novel Transcript Prediction • Gene expression quantification & differential expression analysis • Enrichment Analysis • Operon, Promoter and TSS/TTS Prediction • SD Sequence Prediction • Rho-independent Terminator Sequence Prediction • sRNA Secondary Structure Prediction • sRNA Targeted Gene Prediction

프로젝트 워크플로우

Novogene의 원핵생물 RNA-seq 워크플로는 엄격한 단계별 프로세스를 통해 고품질 결과를 보장합니다.

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Sequencing Platform	Illumina NovaSeq System
Read Length	Paired-end 150bp
Recommended Data Amount	≥ 2Gb raw data per sample for the species with reference genome
Content of Data Analysis	• Data Quality Control • Alignment to Reference Genome • Gene Expression Analysis • Novel Transcript Prediction • Gene expression quantification & differential expression analysis • Enrichment Analysis • Operon, Promoter and TSS/TTS Prediction • SD Sequence Prediction • Rho-independent Terminator Sequence Prediction • sRNA Secondary Structure Prediction • sRNA Targeted Gene Prediction

프로젝트 워크플로우

Novogene의 원핵생물 RNA-seq 워크플로는 엄격한 단계별 프로세스를 통해 고품질 결과를 보장합니다.

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Sequencing Platform	Illumina NovaSeq System
Read Length	Paired-end 150bp
Recommended Data Amount	≥ 2Gb raw data per sample for the species with reference genome
Content of Data Analysis	• Data Quality Control • Alignment to Reference Genome • Gene Expression Analysis • Novel Transcript Prediction • Gene expression quantification & differential expression analysis • Enrichment Analysis • Operon, Promoter and TSS/TTS Prediction • SD Sequence Prediction • Rho-independent Terminator Sequence Prediction • sRNA Secondary Structure Prediction • sRNA Targeted Gene Prediction

프로젝트 워크플로우

Novogene의 원핵생물 RNA-seq 워크플로는 엄격한 단계별 프로세스를 통해 고품질 결과를 보장합니다.

데이터 분석 예시

1/1

샘플 간 상관관계 히트맵

샘플 간 상관관계 히트맵은 색상 강도를 통해 서로 다른 샘플 간 발현 프로파일 또는 데이터 패턴의 유사성을 시각적으로 보여주어 데이터 재현성과 샘플 그룹화의 일관성을 평가하는 데 도움을 줍니다.

1/1

주성분 분석(PCA) 플롯

주성분 분석(PCA) 결과는 고차원 데이터의 복잡성을 시각적으로 줄여 전반적인 패턴, 샘플 군집 및 잠재적 이상치를 보여주며, 데이터 품질과 생물학적 변이를 평가하는 데 도움을 줍니다.

1/1

벤 다이어그램 (공통 발현 유전자)

공발현 벤 다이어그램은 여러 실험군에서 공통적이거나 고유한 공발현 유전자 세트를 직관적으로 식별하여 공유되거나 특이적인 공발현 패턴을 발견하는 데 도움을 줍니다.

1/1

Differentially Expressed Gene Volcano Plot

The Differentially expressed gene volcano plot intuitively visualizes the magnitude of expression changes (fold change) and statistical significance (p-value) of differential genes, enabling rapid identification of significantly upregulated or downregulated genes.

1/1

Differentially Expressed Gene Clustering Heatmap

This heatmap clusters differentially expressed genes by their expression patterns, visually highlighting similarities/differences in gene expression across samples to facilitate the identification of functionally related gene groups.

1/1

Enrichment Analysis Scatter Plot

This scatter plot visualizes enrichment analysis results by mapping enriched terms (e.g., pathways/GO terms) against metrics like enrichment score and significance, enabling intuitive identification of key functional categories associated with target genes.

1/1

Protein–protein Interaction Network

This analysis constructs and dissects networks of physical/functional interactions between proteins to reveal core functional modules, key hub proteins, and potential molecular mechanisms underlying biological processes or diseases.

1/1

샘플 간 상관관계 히트맵

1/1

주성분 분석(PCA) 플롯

1/1

벤 다이어그램 (공통 발현 유전자)

1/1

Differentially Expressed Gene Volcano Plot

1/1

Differentially Expressed Gene Clustering Heatmap

1/1

Enrichment Analysis Scatter Plot

1/1

Protein–protein Interaction Network

데이터 분석 예시

1/1

샘플 간 상관관계 히트맵

1/1

주성분 분석(PCA) 플롯

1/1

벤 다이어그램 (공통 발현 유전자)

1/1

Differentially Expressed Gene Volcano Plot

1/1

Differentially Expressed Gene Clustering Heatmap

1/1

Enrichment Analysis Scatter Plot

1/1

Protein–protein Interaction Network

1/1

샘플 간 상관관계 히트맵

1/1

주성분 분석(PCA) 플롯

1/1

벤 다이어그램 (공통 발현 유전자)

1/1

Differentially Expressed Gene Volcano Plot

1/1

Differentially Expressed Gene Clustering Heatmap

1/1

Enrichment Analysis Scatter Plot

1/1

Protein–protein Interaction Network

다른 서비스 탐색

미생물 De novo Seq

미생물 WGS

Metatranscriptome Seq

프로젝트를 시작할 준비가 되셨나요?

문의 내용을 보내주시면 Novogene 전문가가 연락드리겠습니다.