샷건 메타지놈 시퀀싱은 단편 및 장편 읽기 방식을 포함하여, 미생물 분리나 배양, 또는 표적 영역 증폭 없이 시료 내 전체 유전체 DNA를 분석합니다. 이 방법은 실험실에서 배양할 수 없는 99%의 미생물을 연구하는 데 필수적입니다. 16S, 18S, ITS 앰플리콘 시퀀싱과 같은 표적 시퀀싱과 달리, 차세대(NGS) 및 3세대(TGS) 시퀀싱 기술을 활용해 상세한 분류학적 주석, 기능적 프로파일링, 유전자 예측, 그리고 미생물 상호작용에 대한 통찰을 제공합니다.
Novogene의 첨단 전문성과 생물정보학 파이프라인은 고품질 데이터와 출판 준비가 완료된 결과, 맞춤형 분석을 제공하여 미생물 군집 구조, 종 분류, 유전자 기능, 대사 네트워크 연구를 지원합니다.
분리나 표적 증폭 없이 여러 미생물을 동시에 프로파일링하여 명확하고 신뢰할 수 있는 인사이트를 얻으세요.
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다양한 샘플 유형에서 고품질 결과를 얻을 수 있으며, 완전한 유전체 매핑을 위한 장독립 읽기 조립으로 성능이 향상됩니다.
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지역별 기술지원팀과 연구소가 맞춤형이고 신속한 서비스를 제공합니다.
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복잡한 시료와 까다로운 연구 디자인에 맞추어 유연한 프로젝트를 설계합니다.
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QC 통과 후 약 2주 후 데이터 제공이 시작됩니다.
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Zymo 기준과 엄격한 컨탬 관리로 검증된 업계 최고 수준의 시퀀싱 품질을 제공합니다.
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분리나 표적 증폭 없이 여러 미생물을 동시에 프로파일링하여 명확하고 신뢰할 수 있는 인사이트를 얻으세요.
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다양한 샘플 유형에서 고품질 결과를 얻을 수 있으며, 완전한 유전체 매핑을 위한 장독립 읽기 조립으로 성능이 향상됩니다.
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지역별 기술지원팀과 연구소가 맞춤형이고 신속한 서비스를 제공합니다.
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복잡한 시료와 까다로운 연구 디자인에 맞추어 유연한 프로젝트를 설계합니다.
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QC 통과 후 약 2주 후 데이터 제공이 시작됩니다.
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Zymo 기준과 엄격한 컨탬 관리로 검증된 업계 최고 수준의 시퀀싱 품질을 제공합니다.
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분류학적 프로파일링부터 기능 분석, 대사 네트워크에 이르기까지, 샷건 메타지놈 시퀀싱은 다음과 같은 다양한 연구 분야에 활용될 수 있습니다:
미생물의 구성과 기능을 완벽하게 주석 처리하여 샘플 내 생명의 설계도를 밝혀냅니다.
미생물의 구성과 기능을 완벽하게 주석 처리하여 샘플 내 생명의 설계도를 밝혀냅니다.
인간 건강, 환경 복원, 에너지 합성과 관련된 주요 미생물을 정확하게 검출합니다.
인간 건강, 환경 복원, 에너지 합성과 관련된 주요 미생물을 정확하게 검출합니다.
미생물의 유전적 구성과 대사 메커니즘을 깊이 있게 연구하여 약물 개발의 기초 단서를 제공합니다.
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미생물과 호스트 간의 관계를 깊이 탐구하여 새로운 약물 개발의 길을 엽니다.
미생물과 호스트 간의 관계를 깊이 탐구하여 새로운 약물 개발의 길을 엽니다.
분류학적 프로파일링부터 기능 분석, 대사 네트워크에 이르기까지, 샷건 메타지놈 시퀀싱은 다음과 같은 다양한 연구 분야에 활용될 수 있습니다:
미생물의 구성과 기능을 완벽하게 주석 처리하여 샘플 내 생명의 설계도를 밝혀냅니다.
미생물의 구성과 기능을 완벽하게 주석 처리하여 샘플 내 생명의 설계도를 밝혀냅니다.
인간 건강, 환경 복원, 에너지 합성과 관련된 주요 미생물을 정확하게 검출합니다.
인간 건강, 환경 복원, 에너지 합성과 관련된 주요 미생물을 정확하게 검출합니다.
미생물의 유전적 구성과 대사 메커니즘을 깊이 있게 연구하여 약물 개발의 기초 단서를 제공합니다.
미생물의 유전적 구성과 대사 메커니즘을 깊이 있게 연구하여 약물 개발의 기초 단서를 제공합니다.
미생물과 호스트 간의 관계를 깊이 탐구하여 새로운 약물 개발의 길을 엽니다.
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샘플 양은 참고용으로만 제시되어 있습니다. 자세한 내용은 샘플준비 가이드를 다운로드하여 확인하세요. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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|---|---|---|---|---|---|
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| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
|
| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
|||
| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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Novogene은 프로젝트 전 과정에 걸쳐 고품질 제품과 전문 서비스를 제공합니다. 모든 단계는 엄격한 과학적 기준을 충족하도록 신중하게 설계되고 수행되어 뛰어난 연구 성과를 보장합니다. 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해, 각 단계마다 엄격한 품질 관리(QC) 조치가 시행됩니다. 이 작업 흐름은 시료 준비 및 정량, 분해 및 라이브러리 준비, 라이브러리 품질 관리, 시퀀싱, 그리고 생물정보학 분석과 같은 주요 단계를 포함합니다.
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| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
|
| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
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| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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Novogene은 프로젝트 전 과정에 걸쳐 고품질 제품과 전문 서비스를 제공합니다. 모든 단계는 엄격한 과학적 기준을 충족하도록 신중하게 설계되고 수행되어 뛰어난 연구 성과를 보장합니다. 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해, 각 단계마다 엄격한 품질 관리(QC) 조치가 시행됩니다. 이 작업 흐름은 시료 준비 및 정량, 분해 및 라이브러리 준비, 라이브러리 품질 관리, 시퀀싱, 그리고 생물정보학 분석과 같은 주요 단계를 포함합니다.
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| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
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| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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|---|---|---|---|---|
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| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
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| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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Novogene은 프로젝트 전 과정에 걸쳐 고품질 제품과 전문 서비스를 제공합니다. 모든 단계는 엄격한 과학적 기준을 충족하도록 신중하게 설계되고 수행되어 뛰어난 연구 성과를 보장합니다. 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해, 각 단계마다 엄격한 품질 관리(QC) 조치가 시행됩니다. 이 작업 흐름은 시료 준비 및 정량, 분해 및 라이브러리 준비, 라이브러리 품질 관리, 시퀀싱, 그리고 생물정보학 분석과 같은 주요 단계를 포함합니다.
권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
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| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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Novogene은 프로젝트 전 과정에 걸쳐 고품질 제품과 전문 서비스를 제공합니다. 모든 단계는 엄격한 과학적 기준을 충족하도록 신중하게 설계되고 수행되어 뛰어난 연구 성과를 보장합니다. 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해, 각 단계마다 엄격한 품질 관리(QC) 조치가 시행됩니다. 이 작업 흐름은 시료 준비 및 정량, 분해 및 라이브러리 준비, 라이브러리 품질 관리, 시퀀싱, 그리고 생물정보학 분석과 같은 주요 단계를 포함합니다.
인터액티브 확대 차트는 여러 수준에서 분류학적 풍부도를 보여주어 복잡한 마이크로바이옴을 쉽게 탐색할 수 있게 합니다.
노드는 화학물질을, 사각형은 효소를 나타내며, 색상은 유전자 수준을 보여주는데 빨간색일수록 값이 높습니다.
내성 유전자의 상대적 풍부도를 계산하여, 샘플별 분포와 내성 유형을 보여줍니다.
Bray‑Curtis distance groups samples by protein family profiles, showing both clustering trees and abundance patterns.
Non‑parametric tests detect significantly different features; * marks q<0.05 and ** marks q<0.01 across samples.
Shows top 35 taxa with Z‑score normalization; colors indicate abundance levels, with clustering for sample similarity.
인터액티브 확대 차트는 여러 수준에서 분류학적 풍부도를 보여주어 복잡한 마이크로바이옴을 쉽게 탐색할 수 있게 합니다.
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샷건 메타지놈 시퀀싱은 단편 및 장편 읽기 방식을 포함하여, 미생물 분리나 배양, 또는 표적 영역 증폭 없이 시료 내 전체 유전체 DNA를 분석합니다. 이 방법은 실험실에서 배양할 수 없는 99%의 미생물을 연구하는 데 필수적입니다. 16S, 18S, ITS 앰플리콘 시퀀싱과 같은 표적 시퀀싱과 달리, 차세대(NGS) 및 3세대(TGS) 시퀀싱 기술을 활용해 상세한 분류학적 주석, 기능적 프로파일링, 유전자 예측, 그리고 미생물 상호작용에 대한 통찰을 제공합니다.
Novogene의 첨단 전문성과 생물정보학 파이프라인은 고품질 데이터와 출판 준비가 완료된 결과, 맞춤형 분석을 제공하여 미생물 군집 구조, 종 분류, 유전자 기능, 대사 네트워크 연구를 지원합니다.
분리나 표적 증폭 없이 여러 미생물을 동시에 프로파일링하여 명확하고 신뢰할 수 있는 인사이트를 얻으세요.
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다양한 샘플 유형에서 고품질 결과를 얻을 수 있으며, 완전한 유전체 매핑을 위한 장독립 읽기 조립으로 성능이 향상됩니다.
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지역별 기술지원팀과 연구소가 맞춤형이고 신속한 서비스를 제공합니다.
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복잡한 시료와 까다로운 연구 디자인에 맞추어 유연한 프로젝트를 설계합니다.
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QC 통과 후 약 2주 후 데이터 제공이 시작됩니다.
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Zymo 기준과 엄격한 컨탬 관리로 검증된 업계 최고 수준의 시퀀싱 품질을 제공합니다.
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분리나 표적 증폭 없이 여러 미생물을 동시에 프로파일링하여 명확하고 신뢰할 수 있는 인사이트를 얻으세요.
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다양한 샘플 유형에서 고품질 결과를 얻을 수 있으며, 완전한 유전체 매핑을 위한 장독립 읽기 조립으로 성능이 향상됩니다.
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지역별 기술지원팀과 연구소가 맞춤형이고 신속한 서비스를 제공합니다.
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복잡한 시료와 까다로운 연구 디자인에 맞추어 유연한 프로젝트를 설계합니다.
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QC 통과 후 약 2주 후 데이터 제공이 시작됩니다.
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Zymo 기준과 엄격한 컨탬 관리로 검증된 업계 최고 수준의 시퀀싱 품질을 제공합니다.
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분류학적 프로파일링부터 기능 분석, 대사 네트워크에 이르기까지, 샷건 메타지놈 시퀀싱은 다음과 같은 다양한 연구 분야에 활용될 수 있습니다:
미생물의 구성과 기능을 완벽하게 주석 처리하여 샘플 내 생명의 설계도를 밝혀냅니다.
미생물의 구성과 기능을 완벽하게 주석 처리하여 샘플 내 생명의 설계도를 밝혀냅니다.
인간 건강, 환경 복원, 에너지 합성과 관련된 주요 미생물을 정확하게 검출합니다.
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미생물의 유전적 구성과 대사 메커니즘을 깊이 있게 연구하여 약물 개발의 기초 단서를 제공합니다.
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미생물과 호스트 간의 관계를 깊이 탐구하여 새로운 약물 개발의 길을 엽니다.
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분류학적 프로파일링부터 기능 분석, 대사 네트워크에 이르기까지, 샷건 메타지놈 시퀀싱은 다음과 같은 다양한 연구 분야에 활용될 수 있습니다:
미생물의 구성과 기능을 완벽하게 주석 처리하여 샘플 내 생명의 설계도를 밝혀냅니다.
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인간 건강, 환경 복원, 에너지 합성과 관련된 주요 미생물을 정확하게 검출합니다.
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미생물의 유전적 구성과 대사 메커니즘을 깊이 있게 연구하여 약물 개발의 기초 단서를 제공합니다.
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미생물과 호스트 간의 관계를 깊이 탐구하여 새로운 약물 개발의 길을 엽니다.
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샘플 양은 참고용으로만 제시되어 있습니다. 자세한 내용은 샘플준비 가이드를 다운로드하여 확인하세요. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
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|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
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| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
샘플 양은 참고용으로만 제시되어 있습니다. 자세한 내용은 샘플준비 가이드를 다운로드하여 확인하세요. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
|
| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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Novogene은 프로젝트 전 과정에 걸쳐 고품질 제품과 전문 서비스를 제공합니다. 모든 단계는 엄격한 과학적 기준을 충족하도록 신중하게 설계되고 수행되어 뛰어난 연구 성과를 보장합니다. 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해, 각 단계마다 엄격한 품질 관리(QC) 조치가 시행됩니다. 이 작업 흐름은 시료 준비 및 정량, 분해 및 라이브러리 준비, 라이브러리 품질 관리, 시퀀싱, 그리고 생물정보학 분석과 같은 주요 단계를 포함합니다.
권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
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| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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Novogene은 프로젝트 전 과정에 걸쳐 고품질 제품과 전문 서비스를 제공합니다. 모든 단계는 엄격한 과학적 기준을 충족하도록 신중하게 설계되고 수행되어 뛰어난 연구 성과를 보장합니다. 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해, 각 단계마다 엄격한 품질 관리(QC) 조치가 시행됩니다. 이 작업 흐름은 시료 준비 및 정량, 분해 및 라이브러리 준비, 라이브러리 품질 관리, 시퀀싱, 그리고 생물정보학 분석과 같은 주요 단계를 포함합니다.
권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
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| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
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| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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Novogene은 프로젝트 전 과정에 걸쳐 고품질 제품과 전문 서비스를 제공합니다. 모든 단계는 엄격한 과학적 기준을 충족하도록 신중하게 설계되고 수행되어 뛰어난 연구 성과를 보장합니다. 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해, 각 단계마다 엄격한 품질 관리(QC) 조치가 시행됩니다. 이 작업 흐름은 시료 준비 및 정량, 분해 및 라이브러리 준비, 라이브러리 품질 관리, 시퀀싱, 그리고 생물정보학 분석과 같은 주요 단계를 포함합니다.
샘플 양은 참고용으로만 제시되어 있습니다. 자세한 내용은 샘플준비 가이드를 다운로드하여 확인하세요. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
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| Service | Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
|---|---|---|---|---|---|
| Shotgun Metagenomic Sequencing | Total DNA | ≥ 100 ng | ≥ 20 μL | ≥ 5 ng/μL | OD260/280 = 1.8-2.0. no degradation, no contamination Fragments longer than 500 bp |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (PacBio） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
| Shotgun Metagenomic Sequencing (Nanopore） | HMW genomic DNA (metagenomics) | ≥ 5.5 μg | ≥ 50 μL | ≥ 80 ng/μL | OD260/280=1.7~2.5. OD260/230=1.1~2.6. NC/QC=0.95~4.00 Fragments should be ≥10K |
권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
|
| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
|||
| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
|||
Novogene은 프로젝트 전 과정에 걸쳐 고품질 제품과 전문 서비스를 제공합니다. 모든 단계는 엄격한 과학적 기준을 충족하도록 신중하게 설계되고 수행되어 뛰어난 연구 성과를 보장합니다. 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해, 각 단계마다 엄격한 품질 관리(QC) 조치가 시행됩니다. 이 작업 흐름은 시료 준비 및 정량, 분해 및 라이브러리 준비, 라이브러리 품질 관리, 시퀀싱, 그리고 생물정보학 분석과 같은 주요 단계를 포함합니다.
권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
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| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
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| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq Platforms | PacBio Platforms | Nanopore Platforms | |
|---|---|---|---|---|
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 6Gb for simple environments ≥ 12Gb for complex environments | ≥ 10Gb for simple environments | ≥ 10Gb for simple environments (Note: Analysis performed using integrated short‑read (NGS) and long‑read sequencing data.) |
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| Analysis Options (Choose among these three) | Standard Analysis(Assembly-based) | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, eggNOG, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses | Data quality control (host contamination removal if required) Metagenome Assembly Gene Prediction Taxonomy Annotation Function Annotation (KEGG, GO, CAZY…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Antibiotic Resistance Gene and Mobile Genetic Elements Annotation and Analyses |
| MetaPhlAn4-HUMAnN3(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( MetaCyc, KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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| Kraken2(Reads-Mapping Based) | Data quality control (host contamination removal if required) Taxonomy Annotation Function Annotation ( KEGG, eggNOG, GO…etc) Alpha and Beta Diversity Analyses Differential analysis between groups of species and function. |
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인터액티브 확대 차트는 여러 수준에서 분류학적 풍부도를 보여주어 복잡한 마이크로바이옴을 쉽게 탐색할 수 있게 합니다.
노드는 화학물질을, 사각형은 효소를 나타내며, 색상은 유전자 수준을 보여주는데 빨간색일수록 값이 높습니다.
내성 유전자의 상대적 풍부도를 계산하여, 샘플별 분포와 내성 유형을 보여줍니다.
Bray‑Curtis distance groups samples by protein family profiles, showing both clustering trees and abundance patterns.
Non‑parametric tests detect significantly different features; * marks q<0.05 and ** marks q<0.01 across samples.
Shows top 35 taxa with Z‑score normalization; colors indicate abundance levels, with clustering for sample similarity.
인터액티브 확대 차트는 여러 수준에서 분류학적 풍부도를 보여주어 복잡한 마이크로바이옴을 쉽게 탐색할 수 있게 합니다.
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Bray‑Curtis distance groups samples by protein family profiles, showing both clustering trees and abundance patterns.
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Shows top 35 taxa with Z‑score normalization; colors indicate abundance levels, with clustering for sample similarity.
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Bray‑Curtis distance groups samples by protein family profiles, showing both clustering trees and abundance patterns.
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Bray‑Curtis distance groups samples by protein family profiles, showing both clustering trees and abundance patterns.
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