Xenium In Situ Spatial Transcriptome

Xenium Spatial

Xenium In Situ 플랫폼은 subcellular resolution에서 5,000개 이상의 표적 유전자 발현을 동시에 분석할 수 있습니다. 이 기술은 단일분자 RNA 혼성화와 정교한 광학 기술을 결합하여 개별 조직 절편 내에서 5,000개 이상의 표적 유전자를 정밀하게 검출하고 분석합니다. Fresh frozen(OCT compound embedded) 및 FFPE 조직과 호환되며, 종양 생물학, 신경과학, 면역학을 비롯한 다양한 응용 분야에 탁월한 미시적 관점을 제공합니다.

Xenium 공간 전사체 분석에 Novogene을 선택해야 하는 이유

단일세포 해상도 및 다중모달 분할

세포막, 핵 및 세포질 염색과 AI 기반 분할을 통해 세포 경계를 정밀하게 식별합니다.

고충실도 정보

RNA 투과화 없이 직접 in situ 이미징을 수행하여 공간적 맥락과 분자적 무결성을 보존합니다.

맞춤형 유전자 구성

맞춤형 표적, 스플라이스 변이체, 종간 분석 및 이종이식 검출을 지원합니다.

고충실도 정보

최적화된 프로브와 증폭 기술을 통해 복잡한 조직 환경에서 저발현 유전자를 검출할 수 있습니다.

Xenium In Situ 공간 전사체 시퀀싱의 응용 분야

유전 질환, 암 및 집단 연구를 위해 인간 유전학에 대한 포괄적인 통찰을 확보합니다.

종양 미세환경 연구

종양 미세환경의 분자적 및 세포적 양상을 규명합니다.

면역학

조직 내 면역세포의 공간적 분포와 상호작용을 매핑합니다.

신경과학

전례 없는 해상도로 신경세포의 기능과 발현 패턴을 조사합니다.

바이오마커 발굴

질병 진단 및 치료법 개발을 위한 세포 특이적 바이오마커를 식별합니다.

세부사항

샘플 준비방법

샘플 양은 참고용으로만 제시되어 있습니다. 자세한 내용은 샘플준비 가이드를 다운로드하여 확인하세요. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Sample Type	Amount	Storage Conditions	Sample QC	Shipping
FFPE Tissue Block	1 block, FFPE block must be contained on plastic dehydrating box, otherwise could not be installed on the sectioning device	After embedding store at 4°C, protected from light	DV200% ≥ 30%	4°C or Room Temperature

샘플 준비방법

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세부사항

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데이터 분석 예시

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세포 공간 클러스터링 분석: 공간 분포 및 UMAP

(왼쪽) 세포의 공간적 분포를 그래프 기반 클러스터링 할당 결과에 따라 색상으로 구분하여 표시합니다. 각 색상은 유전자 발현 프로파일이 유사한 세포 클러스터를 나타내며, 조직 내 공간적으로 구분되는 세포 집단에 대한 통찰을 제공합니다. 대형 샘플의 경우 성능 최적화를 위해 일부 세포만 시각화합니다.

오른쪽) 세포의 UMAP 투영으로, 각 클러스터는 서로 다른 색상으로 표시됩니다. 이 2차원 임베딩은 클러스터 간 관계를 강조하며, 서로 가까이 위치한 세포일수록 유전자 발현 프로파일이 더 유사합니다. 대규모 데이터세트에서는 명확한 표시를 위해 일부 세포만 시각화합니다.

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마커 유전자 버블 플롯

서로 다른 클러스터에서 마커 유전자의 발현을 계산 계산하고 버블 플롯으로 시각화합니다. 각 클러스터의 상위 4개 유전자 결과는 위와 같습니다.

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마커 유전자 바이올린 플롯

서로 다른 클러스터에서 마커 유전자의 발현을 계산하고 바이올린 플롯으로 시각화합니다. 각 클러스터의 상위 4개 유전자 결과는 위와 같습니다.

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단일세포 해상도 및 다중모달 분할

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RNA 투과화 없이 직접 in situ 이미징을 수행하여 공간적 맥락과 분자적 무결성을 보존합니다.

맞춤형 유전자 구성

맞춤형 표적, 스플라이스 변이체, 종간 분석 및 이종이식 검출을 지원합니다.

고충실도 정보

최적화된 프로브와 증폭 기술을 통해 복잡한 조직 환경에서 저발현 유전자를 검출할 수 있습니다.

Xenium In Situ 공간 전사체 시퀀싱의 응용 분야

유전 질환, 암 및 집단 연구를 위해 인간 유전학에 대한 포괄적인 통찰을 확보합니다.

종양 미세환경 연구

종양 미세환경의 분자적 및 세포적 양상을 규명합니다.

면역학

조직 내 면역세포의 공간적 분포와 상호작용을 매핑합니다.

신경과학

전례 없는 해상도로 신경세포의 기능과 발현 패턴을 조사합니다.

바이오마커 발굴

질병 진단 및 치료법 개발을 위한 세포 특이적 바이오마커를 식별합니다.

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마커 유전자 버블 플롯

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마커 유전자 바이올린 플롯

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