Plant and Animal Whole Genome Sequencing

Plant & Animal WGS

식물과 동물 종의 유전적 변이, 유전체 구조, 생물학적 다양성을 규명하기 위한 종합적인 Whole genome 시퀀싱.

식물 및 동물 전체 유전체 시퀀싱(PAWGS)은 연구자들이 생물체의 전체 유전체를 시퀀싱할 수 있게 해주는 강력한 기술입니다. 이는 단일 염기 해상도로 전체 유전 서열을 결정합니다. 재시퀀싱에 집중함으로써 PAWGS는 단일 염기 변이(SNV), 삽입 및 결실(InDels), 복제 수 변이(CNV), 구조 변이(SV) 등 포괄적인 유전 변이를 식별합니다. 이러한 통찰은 진화, 집단 유전학, 질병 유전체학 연구를 촉진합니다. 이 방법은 집단유전학 연구, 전장유전체 연관 연구(GWAS), 동물 육종 프로그램, 농업 연구 등 다양한 분야에서 널리 활용되고 있습니다.

Novogene은 다양한 종에 걸쳐 식물과 동물의 전체 유전체 시퀀싱 분야에서 풍부한 경험을 보유하고 있습니다. 저희는 연구 목적에 따라 롱리드 또는 숏리드 시퀀싱 전략을 선택할 수 있는 유연성을 갖춘 PAWGS 재시퀀싱 서비스를 제공합니다. 저희 종합 서비스는 고품질 데이터, 전문적인 생물정보학 분석, 그리고 출판에 적합한 그림을 제공합니다.

노보진 Plant & Animal Whole Genome Seq: 장점 & 특징

우수한 시퀀싱 데이터 퀄리티

첨단 시퀀싱 플랫폼과 엄격한 품질 관리 과정을 통해 신뢰할 수 있고 정확하며 고품질의 결과를 보장합니다.

종합적 지놈 분석

진화 및 집단 유전학 연구를 지원하기 위해 SNP, InDels, CNV, SV를 검출합니다.

우수한 이형접합 변이 검출

높은 깊이와 균일한 유전체 커버리지는 복잡한 환경에서 이형접합 변이를 정확하게 식별할 수 있게 합니다.

강력한 생물정보학과 전문적인 해석

전문 생물정보학 팀이 GWAS, BSA, 집단유전학 분석을 위한 맞춤형 분석을 제공합니다.

빠르고 확실한 TAT

QC 통과 후 약 2주 후 데이터 제공이 시작됩니다.

연구 분야에서의 PAWGS 활용

Novogene의 종합적인 전장 유전체 시퀀싱 서비스를 통해 연구의 잠재력을 최대한 발휘하세요. 우리는 육종, 보전, 진화생물학 분야의 발전을 이끌기 위해 고품질의 심층 변이 분석을 제공합니다.

기능적 변이를 포괄적으로 규명하기

단편 및 장편 시퀀싱을 모두 활용해 주요 형질의 원인이 되는 SNP, Indel, SV의 전체 스펙트럼을 정확히 검출합니다.

진화 역사와 종분화를 설명

유전자 흐름, 잡종 형성, 염색체 재배열과 같은 유전체 사건을 밝혀내어 종의 기원과 진화 역학을 재구성합니다.

개체군 구조와 다양성 특성화하기

개체군 간 유전적 변이를 프로파일링하여 다양성을 평가하고, 개체군의 역사를 추론하며, 보전 전략을 수립하는 데 활용합니다.

유전체 선택과 개선을 강화하기

가속화된 육종, 유전체 선발, 그리고 유전공학을 위한 새로운 유전자 발견을 위한 기초 유전체 자원을 구축합니다.

세부사항

샘플 준비방법

샘플 양은 참고용으로만 제시되어 있습니다. 자세한 내용은 샘플준비 가이드를 다운로드하여 확인하세요. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

Novogene의 식물 및 동물 WGS 워크플로우는 DNA의 순도, 완전성, 그리고 절편 크기를 확인하기 위한 샘플 품질 관리부터 시작합니다. 이후 고분자량 DNA를 이용해 라이브러리를 준비하며, 프로젝트 요구에 따라 단편 또는 장편 라이브러리를 생성합니다. 정확한 전체 유전체 변이 검출을 위해 Illumina PE150 또는 롱리드 플랫폼을 사용해 시퀀싱을 수행합니다. 수집된 데이터는 엄격한 품질 관리를 거친 후, 변이 분류, 주석, 요약 보고를 포함한 생물정보학 분석을 진행합니다. 최종 산출물은 출판용 FASTQ, BAM/CRAM, VCF 파일, 변이 테이블, 그리고 후속 해석을 지원하는 그래픽 결과물로 구성됩니다.

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

세부사항

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

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Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

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시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

데이터 분석 예시

1/1

구조 변이(SV) 위치 개요

이 차트는 구조 변이(SV)가 위치한 유전체 영역에 대한 개요를 제공합니다.

1/1

SNP 타입 분류

이 그림은 다양한 유전체 영역에서 발견되는 여러 종류의 SNP 비율을 보여줍니다.

1/1

종합적 유전체 변이 맵

이 다이어그램은 유전체의 시각적 지도를 제공하며, SNP/InDels와 다양한 전위 유형(INS, DEL, INV, DUP, BND)을 정확히 표시합니다.

다른 서비스 탐색

Whole Exome Seq (WES)

mRNA Seq

ATAC-seq

Single Cell

Whole Genome Bisulfite Seq (WGBS)

Shotgun Metagenomics

프로젝트를 시작할 준비가 되셨나요?

진행하고자 하는 프로젝트가 있으신가요?

문의 내용을 보내주시면 Novogene 전문가가 연락드리겠습니다.

Plant & Animal WGS

식물과 동물 종의 유전적 변이, 유전체 구조, 생물학적 다양성을 규명하기 위한 종합적인 Whole genome 시퀀싱.

노보진 Plant & Animal Whole Genome Seq: 장점 & 특징

우수한 시퀀싱 데이터 퀄리티

첨단 시퀀싱 플랫폼과 엄격한 품질 관리 과정을 통해 신뢰할 수 있고 정확하며 고품질의 결과를 보장합니다.

종합적 지놈 분석

진화 및 집단 유전학 연구를 지원하기 위해 SNP, InDels, CNV, SV를 검출합니다.

우수한 이형접합 변이 검출

높은 깊이와 균일한 유전체 커버리지는 복잡한 환경에서 이형접합 변이를 정확하게 식별할 수 있게 합니다.

강력한 생물정보학과 전문적인 해석

전문 생물정보학 팀이 GWAS, BSA, 집단유전학 분석을 위한 맞춤형 분석을 제공합니다.

빠르고 확실한 TAT

QC 통과 후 약 2주 후 데이터 제공이 시작됩니다.

연구 분야에서의 PAWGS 활용

기능적 변이를 포괄적으로 규명하기

단편 및 장편 시퀀싱을 모두 활용해 주요 형질의 원인이 되는 SNP, Indel, SV의 전체 스펙트럼을 정확히 검출합니다.

진화 역사와 종분화를 설명

유전자 흐름, 잡종 형성, 염색체 재배열과 같은 유전체 사건을 밝혀내어 종의 기원과 진화 역학을 재구성합니다.

개체군 구조와 다양성 특성화하기

개체군 간 유전적 변이를 프로파일링하여 다양성을 평가하고, 개체군의 역사를 추론하며, 보전 전략을 수립하는 데 활용합니다.

유전체 선택과 개선을 강화하기

가속화된 육종, 유전체 선발, 그리고 유전공학을 위한 새로운 유전자 발견을 위한 기초 유전체 자원을 구축합니다.

세부사항

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

세부사항

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

샘플 준비방법

Platform Type	Sample Type	Amount (Qubit®)	Purity
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA	≥ 100 ng	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
Illumina NovaSeq System	Genomic DNA (PCR free library)	≥ 1.2 μg	A260/280=1.8-2.0;no degradation, no contamination
PacBio Revio System	HMW Genomic DNA (HiFi SMRTbell® library)	≥ 3.5 μg	A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; *NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb
Nanopore PromethION	HMW Genomic DNA	≥ 8.5 μg	A260/280=1.75-2.2; A260/230=1.4-2.6; *NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb

*NC/QC = NanoDrop concentration/Qubit concentration

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

시퀀싱 & 데이터 분석

권장 데이터 생산량과 표시되는 분석 내용은 참고용일 뿐입니다. 자세한 정보가 필요하시면 맞춤 요청을 가지고 저희에게 연락해주세요.

Platform Type	Illumina NovaSeq System	PacBio Revio System	Nanopore PromethION
Read Length	Paired-end 150 bp	Average > 15 kb	Average > 17 kb
Recommended Sequencing Depth	For SNP/InDel detection: ≥ 10×	For SV detection: ≥ 20×
Recommended Sequencing Depth	For SV/CNV detection: ≥ 20×	For SV detection: ≥ 20×
Content of Analysis	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing error rate •Filtering reads containing adapter or with low quality •Alignment with reference genome •Statistics of mapping, sequencing depth and coverage •SNP calling, annotation and statistics Advanced Analysis •SV calling, annotation and statistics •CNV calling, annotation and statistics	Standard Analysis •Data quality control •Sequencing alignment •Structural Variant (SV) detection

프로젝트 워크플로우

데이터 분석 예시

1/1

구조 변이(SV) 위치 개요

이 차트는 구조 변이(SV)가 위치한 유전체 영역에 대한 개요를 제공합니다.

1/1

SNP 타입 분류

이 그림은 다양한 유전체 영역에서 발견되는 여러 종류의 SNP 비율을 보여줍니다.

1/1

종합적 유전체 변이 맵

이 다이어그램은 유전체의 시각적 지도를 제공하며, SNP/InDels와 다양한 전위 유형(INS, DEL, INV, DUP, BND)을 정확히 표시합니다.

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