섬 고유종 조류와 최근 유입종 조류 사이의 잡종화 역학
서론:
전체 게놈 시퀀싱을 통해 노퍽 섬에서 두 종 간의 교잡 신호가 발견되었습니다. 소냐와 그녀의 연구팀은 5배 깊이의 150bp 페어드 엔드 시퀀싱을 사용하여 1,500만 개의 SNP를 확보했고, 이를 바탕으로 두 종의 접촉 이후 유전자 유입이 발생했는지 여부를 분석했습니다. 연구팀은 SNP를 식별하기 위한 임퓨테이션 방법과 D 통계량, 그리고 ABBA/BABA 패턴 분석을 통해 “잡종이 부모 개체군과 역교배하여 유전자 유입이 일어났는가?”라는 질문에 대한 답을 찾고자 했습니다. 그 결과, “그렇다”는 것을 확인했습니다. 양의 D 값, 즉 BABA 패턴보다 ABBA 대립유전자 패턴이 더 많이 나타나는 것은 유전자 유입을 뒷받침합니다. 다음 질문은 “게놈의 어느 부분에서 유전자 유입이 명확하게 나타나는가?”였습니다. 50kb 윈도우와 10kb 슬라이딩 스텝을 사용하는 슬라이딩 윈도우 접근법을 통해 연구팀은 유전자 유입이 게놈 전체에 걸쳐 광범위하게 나타나는 윈도우를 확인했으며, 깃털 색깔, 부리 크기 및 모양과 같은 형질에 대한 흥미로운 후보 유전자들을 이러한 윈도우에서 발견했습니다. 이 유전적 증거는 잡종 개체로 추정되는 일부 박물관 표본의 표현형적 특징과 일치했습니다.