소개:

전장 유전체 시퀀싱을 통해 노퍽섬의 두 종 사이에서 교잡의 신호가 발견되었습니다. Sonya와 연구팀은 5X 깊이의 150bp 페어드엔드 시퀀싱을 사용하여 1,500만 개의 SNP를 확보했으며, 이를 후속 분석에 활용하여 두 종이 접촉한 이후 유전자 침투가 발생했는지를 확인했습니다. SNP를 식별하기 위한 결측치 보완 방법과 D 통계량 및 ABBA/BABA 패턴 분석을 사용하여 연구팀은 “잡종이 부모 집단과 역교배하여 유전자 침투가 발생했는가?”라는 질문을 제기했습니다. 답은 그렇다는 것이었습니다. BABA 패턴보다 ABBA 대립유전자 패턴이 증가했음을 나타내는 양의 D 값은 유전자 침투를 뒷받침합니다. 다음 질문은 “유전체의 어느 영역에서 유전자 침투가 명확하게 나타나는가?”였습니다. 50kb 윈도우와 10kb 슬라이딩 간격을 사용하는 슬라이딩 윈도우 접근법을 통해, 연구팀은 유전자 침투가 발생한 윈도우가 유전체 전반에 걸쳐 널리 분포한다는 것을 보여주었으며, 이들 윈도우에서는 깃털 색상과 부리의 크기 및 형태와 같은 특성과 관련된 흥미로운 후보 유전자들이 두드러졌습니다. 이러한 유전적 증거는 잡종 개체로 여겨지는 일부 박물관 표본의 표현형적 특징과 일치했습니다.

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