By Anna F., Sep 2026

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Single cell 시퀀싱이 생의학 연구를 발전시키고 있지만, 대규모 코호트나 장기 추적, 소중한 임상 샘플을 대상으로 연구를 확장하는 것은 여전히 어려운 과제입니다. 이전 단일 세포 프로젝트 지원 경험에 따르면, 신선한 생존 세포를 신속히 처리해야 할 때는 종종 저희 팀을 현장에 파견해 세포 채취 서비스를 제공해야 했습니다. 플렉스가 이것을 변경합니다. 샘플을 현장에서 바로 고정해 노보진 연구소로 보내 후속 처리를 할 수 있어, 연구자들이 샘플 채취 방법과 시기를 더 유연하게 조절할 수 있습니다. GEM-X Flex v1 제공 경험을 바탕으로, 노보진은 연구자들이 단일 세포 연구 확장의 실질적 장애물을 극복할 수 있도록 차세대 Flex v2 서비스를 제공합니다.

여기서는 Single Cell 연구 확장에 흔히 겪는 네 가지 장애물과 이를 해결하는 데 Flex v2와 노보진의 종합 서비스가 어떻게 도움이 되는지 살펴봅니다.

챌린지 1: 샘플이 서로 다른 시간과 장소에서 컬렉션 됩니다

임상 및 종단 연구는 보통 몇 달에 걸쳐 또는 여러 장소에서 수집된 표본을 포함합니다. 샘플이 도착할 때마다 처리하면 실행 간 변동성이 커지고 연구 조정이 복잡해질 수 있습니다.

Flex v2의 장점: 샘플을 수집 후 고정하여 나중에 함께 저장하고 처리할 수 있습니다. 이를 통해 연구자들은 샘플을 계획된 배치로 통합할 수 있어, 처리 과정에서 발생하는 기술적 변동을 줄이고 코호트 전반의 일관성을 높일 수 있습니다.

노보진이 어떻게 도움이 되는지: 노보진은 10x Genomics 프로토콜에 따른 샘플 고정 서비스를 제공합니다. Flex 워크플로우는 fixed cell과 nuclei, FFPE 샘플, cell suspension, fresh/frozen 조직을 모두 지원하여 연구자들이 샘플 채취, 보관, 송부 과정에서 더 큰 유연성을 가질 수 있도록 합니다. 이를 통해 즉각적인 fresh 샘플 처리에 대한 의존도를 낮추고, 보다 실용적인 연구 계획 수립을 지원합니다.

챌린지 2: Fresh하고 Viable한 세포를 항상 구할 수 있는 것은 아니다

기존의 Single Cell 작업은 보통 신선한 세포를 신속하게 처리해야 합니다. 샘플이 연약하거나 실험실에서 멀리 떨어진 곳에서 채취되었거나 보관된 조직 형태로만 존재할 때는 이 과정이 어려울 수 있습니다.

Flex v2의 장점: 프로브 기반의 작업 흐름은 fixed cell과 nuclei 뿐만 아니라 FFPE 조직도 지원하여 Single Cell 분석에 사용할 수 있는 샘플 범위를 넓혀줍니다. fresh/frozen 시료는 적절한 고정 또는 핵 분리 공정을 통해 처리할 수도 있습니다. 샘플 적합성은 조직 타입, 보존 방법, 샘플 퀄리티 등 여러 요인에 따라 달라집니다.

노보진이 도와드릴 수 있는 점: 국내 싱글셀 담당자와 조기에 상담하시면, 소중한 샘플이 채취되거나 제출되기 전에 가장 적합한 Single Cell 서비스와 절차를 파악할 수 있습니다.

챌린지 3: 높은 비용이 코호트 규모를 제한할 수 있습니다

예산과 워크플로우의 제약으로 인해 Single Cell 연구에 포함되는 샘플 수가 제한되는 경우가 많습니다. 하지만 환자 간 변동성을 파악하거나 치료 반응을 비교하거나 질병 아형을 연구하기 위해서는 더 큰 규모의 코호트가 필요할 수 있습니다.

Flex v2의 장점: 각 샘플은 풀링 전에 고유 바코드로 라벨링되어, 이후 라이브러리 준비와 시퀀싱 과정에서도 동일성을 유지합니다. 여러 샘플을 동시에 처리할 수 있게 함으로써, 이러한 Multi-Plex 워크플로우는 샘플 처리 과정을 간소화하고 비용 효율성을 높여, 더 크고 대표성이 높은 코호트 연구를 보다 쉽게 수행할 수 있도록 합니다.

노보진이 도와드릴 수 있는 점: 노보진은 품질 보증을 위해 최적화된 서비스 워크플로우 내에서 한 번의 검사로 최대 24개 샘플을 지원합니다. 더 높은 Multiplexing 요청이 필요하시면 저희 팀에 문의해 주세요. 싱가포르, 일본, 홍콩에 현지 Single Cell 연구소를 운영하고 있습니다. 연구자분들은 저희 현지 담당자와 연구 설계에 대해 상의하실 수 있습니다. 샘플 수, 시퀀싱 요구사항, 분석 필요성, 예산 등을 종합적으로 검토하여 프로젝트에 적합한 워크플로우를 함께 결정할 수 있습니다. (한국도 싱글셀 랩을 준비중에 있습니다.)

챌린지 4: 샘플 수가 많아질수록 분석 복잡성이 커진다

샘플 수와 세포 처리량이 증가하면 더 풍부한 데이터셋을 얻을 수 있지만, 데이터 통합과 해석이 더 까다로워집니다. 샘플 간 신뢰할 수 있는 비교는 생물학적 차이와 기술적 변이를 구분하는 데 필수적입니다.

노보진이 도와드릴 수 있는 점: 노보진은 세포 또는 핵 품질 관리와 라이브러리 준비부터 시퀀싱 및 BI 분석까지 전 과정을 지원합니다. 분석 가능한 기능으로는 Demultiplexing, 다중 샘플 통합, Cell type annotation, 차등 유전자 발현(DEG), 의사 시간 분석, Cell to cell communication 분석 등이 있어, 연구자들이 복잡한 데이터셋을 의미 있는 생물학적 발견으로 전환할 수 있도록 돕습니다.

다양한 조직 타입에 대한 경험 및 전문성

2026년 기준으로 노보진은 다양한 샘플 유형을 포함해 600건 이상의 Flex 단일 세포 프로젝트를 완료했습니다. 여기에는 심장, 폐, 방광, 뇌종양, 장 림프종, 두경부 편평세포암, 코르도마, 대장암 조직의 고정 세포 및 FFPE 샘플이 포함됩니다. 저희 통합 서비스는 연구 설계 및 샘플 상담, 샘플 평가, 실험실 처리, 시퀀싱 및 BI 분석까지 포함하며, 연구자들이 실험 설계부터 BI 분석까지 전 과정을 지원합니다.

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Anna F.는 노보진 AMEA에서 싱글셀 시퀀싱 및 공간 전사체학 프로덕트 매니저로, 싱가포르 병원, 일루미나, 써모 피셔 사이언티픽에서 기술직으로 9년간 NGS 경험을 쌓았습니다. 이러한 임상 및 산업적 관점을 바탕으로 연구자들이 복잡한 단일 세포 및 공간 생물학 프로젝트를 수행하는 데 크게 기여하고 있습니다.